เพื่อจะช่วยเหลือ "เซย์ย่า" ซึ่งตกอยู่ในภาวะใกล้ตายเพราะคำสาปของ "ฮาเดส" ได้เดินทางข้ามมิติเวลากลับไปยังยุคสมัยของสงครามศักดิ์สิทธิ์ครั้งก่อน! "โครนอส" เทพเจ้าแห่งกาลเวลา ให้เวลาจำกัดเพียงแค่ 3 วันเท่านั้น!! พวกเขาจะสามารถทำลายดาบของฮาเดสให้เป็นผุยผงได้ก่อนที่ทรายในนาฬิกาดารา จะตกลงมาจนหมดหรือไม่!? และ "ฟีนิกซ์ อิคคิ" ก็ได้เข้าเผชิญหน้าวิกฤตที่ไม่เคยมีมาก่อน ซึ่งคืบคลานเข้าใกล้อาธีน่าเข้าไปทุกที...!! โกลด์เซนต์ยุคสงครามศักดิ์สิทธิ์ครั้งก่อนทยอยปรากฏตัวขึ้น!

เพกาซัส เท็มมะ พร้อมด้วยชิออนและโดโก ผู้เป็นโกลด์เซนต์มุ่งหน้าไปยังบ้านเกิดของเท็มมะ ที่มีข่าวลือว่าฮาเดสพื้นคืนชีพขึ้นมาตากรรมอันแสนเศร้าที่รอคอยเขาอยู่ ณ สถานที่แห่งนั้นคืออะไรกัน!? "เจ้านรกฮาเดส" คืนชีพกลับมาอย่างสมบูรณ์! โชคชะตาที่เทพีอาธีน่าและเพกาซัส เท็มมะต้องเผชิญกำลังจะเริ่มขึ้น!

"เด็บบี้ เดอะ คอร์ซิฟา" ปีศาจที่แข็งแกร่งที่สุดจากนรก แต่กลับแพ้การดวลกับ "โรคุโร่" ในทุกวัน จนรุ่นน้องปีศาจของเธอ "เรส์ ยู ริสกี้" ต้องให้เธอยืมพลังปีศาจของตนเอง แต่ทว่า...!? การดวลฆ่าเวลาที่มีชะตาชีวิตของมนุษยชาติเป็นเดิมพัน กับเหล่าปีศาจไม่ค่อยเต็มบาท ที่ไม่ยอมลดละความพยายาม ได้เปิดฉากขึ้นอีกครั้งแล้ว!